沼气净化一般包括沼气的脱水、脱硫和脱碳。再加上甲烷和硫化氢的水分，加速了管道、阀门、流量计的腐蚀。因此，在沼气脱硫过程中，需要满足脱硫过程中沼气的湿度要求，适当冷却高、中温沼气的温度，采用旋风脱水的方法去除沼气中的部分水蒸气。

　　厌氧消化单元刚产生的沼气是含有饱和水蒸气的混合气体，除气态燃料CH4和惰性气体CO2外，还含有一定比例的H2O和H2O，少量的NH3、H2、N2、O2、CO和卤代烃。沼气净化是指除去沼气中除CH4以外的气体。

　　目前沼气净化方法有三种，即化学吸收法、物理净化法和生物去除法。

　　1.化学吸收。化学吸收机理是利用胺、碱、醇等复合溶液吸收剂，利用酸碱中和反应吸收沼气中的CO2、H2S等酸性物质，同时也吸收NH3等易溶于水和醇的气体。另一种化学吸收机理是用干化学品(如Fe2O3)作为吸收剂吸收杂质气体。化学吸收的吸收剂可以通过装置的自净系统和再生系统释放各种杂质和气体，进行回收利用。

　　2.物理净化。通过这种机理净化沼气的主要方法是变压吸附。利用吸附剂在不同压力条件下对不同气体的吸附能力不同的原理，分离沼气中的不同组分。沼气中，吸附量大的H2O、CO2、H2S等强吸附组分在一定压力下被吸附剂吸附并停留在床层中，而吸附量小的N2、CH4等弱吸附组分从床层出口输出，从而实现沼气的净化。

　　3.生物去除。在一定条件下，微生物的生长繁殖需要沼气中的一些杂质气体作为营养物质，从而净化沼气。